The objectives of this study were to investigate the associations between antimicrobial resistance patterns in generic Escherichia coli and Salmonella spp. isolates recovered from identical pen pooled fecal samples, and to evaluate potential clustering of multiple isolates of these organisms within identical fecal samples. Up to 5 generic E. coli (n = 922 isolates) and Salmonella spp. (n = 922 isolates) isolates were obtained from each of 188 pen pooled fecal samples that had been collected from 45 finishing swine farms in Alberta in 2000, and tested for susceptibility to 15 antimicrobials. No isolates of either organism were resistant to 3rd generation cephalosporins or fluoroquinolones, which in Canada are considered antimicrobials of very high importance to human health. Approximately twice as many generic E. coli isolates as Salmonella spp. isolates were resistant to at least 1 antimicrobial. In addition, E. coli isolates showed more multidrug-resistance patterns. No significant association was observed between the resistance phenotypes of Salmonella spp. and E. coli at the fecal sample level. More clustering at the sample level was observed for proportions of antimicrobial resistance (AMR) in Salmonella spp. isolates than E. coli indicating that in future studies it might be sufficient to test fewer than 5 Salmonella spp. isolates per sample.
Les objectifs de la présente étude étaient d’évaluer les associations entre les patrons de résistance aux antimicrobiens d’isolats d’Escherichia coli génériques et de Salmonella spp. provenant de pools d’échantillons de fèces prélevés dans des parcs identiques, et d’évaluer le potentiel de regroupement d’isolats multiples de ces micro-organismes à l’intérieur d’échantillons de fèces identiques. Un maximum de 5 isolats d’E. coli génériques (n = 922) et de Salmonella spp. (n = 922) ont été obtenus de chacun des 188 échantillons de fèces provenant des parcs qui avaient été amassés en 2000 dans 45 troupeaux de porcs en finition en Alberta, et testés pour leur sensibilité à 15 agents antimicrobiens. Aucun isolat des deux micro-organismes n’était résistant aux céphalosporines et fluoroquinolones de 3e génération, qui au Canada sont considérés comme des agents antimicrobiens de très haute importance pour la santé humaine. Environ deux fois plus d’isolats d’E. coli générique que de Salmonella spp. étaient résistants à au moins 1 agent antimicrobien. De plus, les isolats d’E. coli montraient plus de patrons de résistance multiple. Aucune association significative n’a été notée entre les phénotypes de résistance de Salmonella spp. au niveau de l’échantillon de fèces. Plus de regroupements au niveau de l’échantillon étaient observées pour les proportions de résistance aux antimicrobiens (AMR) chez les isolats de Salmonella spp. que ceux d’E. coli indiquant ainsi que dans des études ultérieures il serait suffisant de tester moins que 5 isolats de Salmonella spp. par échantillon.
(Traduit par Docteur Serge Messier)