Identification of suitable reference genes for miRNA expression normalization in gastric cancer

Ana Carolina Anauate; Mariana Ferreira Leal; Fernanda Wisnieski; Leonardo Caires Santos; Carolina Oliveira Gigek; Elizabeth Suchi Chen; Jaqueline Cruz Geraldis; Danielle Queiroz Calcagno; Paulo Pimentel Assumpção; Samia Demachki; Carlos Haruo Arasaki; Laércio Gomes Lourenço; Ricardo Artigiani; Rommel Rodríguez Burbano; Marília Arruda Cardoso Smith

doi:10.1016/j.gene.2017.04.016

Identification of suitable reference genes for miRNA expression normalization in gastric cancer

Gene. 2017 Jul 20:621:59-68. doi: 10.1016/j.gene.2017.04.016. Epub 2017 Apr 12.

Authors

Ana Carolina Anauate¹, Mariana Ferreira Leal², Fernanda Wisnieski¹, Leonardo Caires Santos¹, Carolina Oliveira Gigek³, Elizabeth Suchi Chen¹, Jaqueline Cruz Geraldis¹, Danielle Queiroz Calcagno⁴, Paulo Pimentel Assumpção⁴, Samia Demachki⁴, Carlos Haruo Arasaki⁵, Laércio Gomes Lourenço⁵, Ricardo Artigiani⁶, Rommel Rodríguez Burbano⁷, Marília Arruda Cardoso Smith⁸

Affiliations

¹ Disciplina de Genética, Departamento de Morfologia e Genética, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil.
² Disciplina de Genética, Departamento de Morfologia e Genética, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil; Departamento de Ortopedia e Traumatologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Belém, Brazil.
³ Disciplina de Genética, Departamento de Morfologia e Genética, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil; Disciplina de Gastroenterologia Cirúrgica, Departamento de Cirurgia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil.
⁴ Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Belém, Brazil.
⁵ Disciplina de Gastroenterologia Cirúrgica, Departamento de Cirurgia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil.
⁶ Departamento de Patologia, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil.
⁷ Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Belém, Brazil; Laboratório de Citogenética Humana, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, Brazil; Laboratório de Biologia Molecular, Hospital Ophir Loyola, Belém, Brazil.
⁸ Disciplina de Genética, Departamento de Morfologia e Genética, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, Brazil. Electronic address: macsmith@unifesp.br.

PMID: 28411081
DOI: 10.1016/j.gene.2017.04.016

No abstract available

Keywords: Gene expression; MiR-101-3p, MiR-140-3p, stomach cancer; MicroRNA; Normalization; Reverse transcription quantitative polymerase chain reaction.

MeSH terms

Adenocarcinoma / genetics*
Adenocarcinoma / secondary
Adult
Biomarkers, Tumor / genetics*
Case-Control Studies
Female
Follow-Up Studies
Gastric Mucosa / metabolism*
Gene Expression Profiling
Gene Expression Regulation, Neoplastic
Humans
Lymphatic Metastasis
Male
MicroRNAs / genetics*
MicroRNAs / standards*
Middle Aged
Neoplasm Invasiveness
Prognosis
Reference Standards
Stomach Neoplasms / classification
Stomach Neoplasms / genetics*
Stomach Neoplasms / pathology

Substances

Biomarkers, Tumor
MicroRNAs