Aim: To study the peculiarities of carrying clinically significant allelic variants of TPMT and DPYD genes associated with the response to drug therapy in cancer practice among 9 ethnic groups of the Russian Federation.
Materials and methods: The study included 1446 conditionally healthy volunteers from 9 ethnic groups. Carriage of polymorphic TPMT and DPYD gene markers was detected by the Real-Time PCR (polymerase chain reaction) method.
Results: In all ethnic groups, the distribution of genotypes and alleles matched the equilibrium of Hardy-Weinberg. TPMT*3A (rs1800460) and TPMT*3C (rs1142345) were observed in heterozygous state in all investigated ethnic groups. In the Kabardinian group (n=204) the frequency of the TPMT*3A minor allele (MAF, %) was 2.94%; Balkars (n=200) 1.25%; Ossetians (n=239) 1.67%; Chuvashes (n=238) 1.89%: Mari (n=206) 1.21%; Tatars (n=141) 1.77%; Russians (n=134) 4.85%. The frequency of the TPMT*3C minor allele (MAF, %) in the Kabardinian group (n=204) MAF was 4.90%; Balkars (n=200) 1. 75%; Buryats (n=114) 0.44%; Ossetians (n=239) 1.88%; Chuvashes (n=238) 1.68%: Mari (n=206) 1.21%; Tatars (n=141) 1.42%; Russians (n=134) 4.48%. The results of the analysis of DPYD*2A polymorphism (rs3918290) demonstrated ethnic peculiarities of distribution. In the heterozygous state it was found only in the groups of Kabardins (n=204, MAF 1.22%), Balkars (n=200, MAF 2.00%), and Ossetians (n=239, MAF 0.63%).
Conclusion: The results obtained in the study will be useful for developing personalized algorithms of antitumor therapy in cancer practice, including those aimed at increasing the safety of chemotherapy.
Цель. Изучить особенности носительства клинически значимых аллельных вариантов генов TPMT и DPYD, ассоциированных с ответом на лекарственную терапию гемобластозов, среди 9 этнических групп Российской Федерации. Материалы и методы. В исследование включены 1446 условно здоровых добровольцев 9 этнических групп. Носительство полиморфных маркеров генов TPMT и DPYD выявлялось методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Результаты. Во всех этнических группах распределение генотипов и аллелей соответствовало равновесию ХардиВайнберга. TPMT*3A (rs1800460) и TPMT*3C (rs1142345) наблюдались во всех исследуемых этнических группах в гетерозиготном состоянии. В группе кабардинцев (n=204) частота встречаемости минорного аллеля TPMT*3A (MAF, %) составила 2,94%; балкарцев (n=200) 1,25%; осетин (n=239) 1,67%; чувашей (n=238) 1,89%; марийцев (n=206) 1,21%; татар (n=141) 1,77%; русских (n=134) 4,85%. Частота встречаемости минорного аллеля TPMT*3С (MAF, %) в группе кабардинцев (n=204) составила 4,90%; балкарцев (n=200) 1,75%; бурятов (n=114) 0,44%; осетин (n=239) 1,88%; чувашей (n=238) 1,68%; марийцев (n=206) 1,21%; татар (n=141) 1,42%; русских (n=134) 4,48%. Результаты анализа полиморфизм DPYD*2A (rs3918290) продемонстрировали важные этнические особенности распределения. В гетерозиготном состоянии он выявлен лишь в группах кабардинцев (n=204, MAF 1,22%), балкарцев (n=200, MAF 2,00%), осетин (n=239, MAF 0,63%). Заключение. Полученные в исследовании результаты будут полезны для разработки персонализированных алгоритмов противоопухолевой терапии в онкологической практике, в том числе направленных на повышение безопасности химиотерапевтического лечения гемобластозов.
Keywords: DPYD; TPMT; chemotherapy; ethnic groups; pharmacogenetic.