The recent context of COVID-19 has renewed the interest of pathologists in diseases of infectious origin. This interest is even stronger in the gastrointestinal tract where symptoms are aspecific, often frustrating with a normal endoscopic appearance sometimes leading to diagnostic erraticity. In this context, systematic biopsies performed by the clinician are sometimes the only way to reach a diagnosis. Nevertheless, the precise diagnosis of these pathologies requires a good knowledge of the context in which they occur, the histopathological aspect and a rigorous analysis using special stains and/or immunohistochemical analyses. Some infectious diseases of the gastrointestinal tract are well known to pathologists who are widely called upon to diagnose them (Helicobacter pylori gastritis, Candida albicans oesophagitis or CMV colitis), but others are more difficult to diagnose. In this article, we will present, after having recalled the various useful special stains, rare or difficult to diagnose bacterial or parasitic pathologies "not to be missed" in the digestive tract.
Le contexte récent du COVID-19 a renouvelé l’intérêt des pathologistes pour les maladies d’origine infectieuse. Cet intérêt est d’autant plus fort dans le tube digestif où les symptômes sont aspécifiques, souvent frustres avec un aspect endoscopique normal entraînant parfois une errance diagnostique. Dans ce contexte, les biopsies systématiques réalisées par le clinicien sont parfois le seul moyen de parvenir au diagnostic. Néanmoins, le diagnostic précis de ses pathologies nécessite une bonne connaissance à la fois du contexte de survenue de ces pathologies, de l’aspect histopathologique et d’une analyse rigoureuse utilisant des colorations spéciales et/ou des analyses immunohistochimiques. Certaines pathologies infectieuses du tube digestif sont bien connues par les pathologistes qui sont largement sollicités dans leurs diagnostics (gastrite à Helicobacter pylori, œsophagite à Candida albicans ou la colite à CMV), mais d’autres sont plus délicates à diagnostiquer. Dans cet article, nous présenterons, après avoir rappelé les différentes colorations spéciales utiles, des pathologies bactériennes ou parasitaires rares ou de diagnostic difficile « à ne pas manquer » dans le tube digestif.
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